土壤学报

作者：刘泽锟，黄士轩，杨美艳

单位：刘泽锟，华南农业大学食品学院, 广东省食品质量安全重点实验室, 广州 510642;华南农业大学农学院, 广州 510642；,黄士轩，华南农业大学食品学院, 广东省食品质量安全重点实验室, 广州 510642;华南农业大学农学院, 广州 510642；,杨美艳，华南农业大学食品学院, 广东省食品质量安全重点实验室, 广州 510642；ymy@scau.edu.cn,

关键词：病毒组学;土壤;稻田;碳水化合物活性酶

基金：国家自然科学基金项目（32202194）、广东省微生物安全与健康重点实验室开放课题（2020B121201009-PKLMSH003-2021）和广州市重点研发计划项目（SL2022B03J01243）资助

病毒是地球上最丰富多样的微生物类群，广泛存在于各种生物体及环境中，但关于稻田土壤的病毒组研究较少。使用公共数据库中的稻田土壤宏基因组测序数据，构建由8 791个病毒操作分类单元（viral operational taxonomic units，vOTU）和168 940个蛋白序列组成的稻田土壤病毒数据库（Paddy soil virus database，PSVD），该数据库中31.41%的序列能够预测出物种分类地位信息，这些病毒序列分属于76个已知的病毒科，以有尾病毒纲（Caudoviricetes）病毒为主，宿主分布在11个细菌门中。同时还对稻田土壤病毒中所携带的辅助代谢基因（Auxiliary Metabolic Genes，AMGs）进行分析，发现了39个可能广泛存在与稻田系统的碳水化合物活性酶（carbohydrate active enzymes，CAZymes），该类基因的存在，可能对生物地球化学循环产生潜在的影响。综上，本研究创新性构建了PSVD数据库（https：//github.com/lzk98/PSVD），并利用DRAM-v挖掘了稻田土壤系统中的AMGs基因，为后期稻田土壤病毒组的研究奠定了研究基础，并为稻田病毒群落的解析提供新的见解。

来源：2024年第6期

《土壤学报》期刊编辑部

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