土壤学报

作者：祁慧鹓，郑晓璇，孙明明，王金锋，马迎飞，朱冬，王风贺，蒋新，叶茂

单位：祁慧鹓，中国科学院南京土壤研究所, 土壤环境与污染修复重点实验室, 南京 210008;中国科学院大学, 北京 100049；,郑晓璇，南京农业大学资源与环境科学学院, 土壤生态学实验室, 南京 210095；,孙明明，南京农业大学资源与环境科学学院, 土壤生态学实验室, 南京 210095；,王金锋，中国科学院北京生命科学研究院, 北京 100101；,马迎飞，中国科学院深圳先进技术研究院, 深圳 518055；,朱冬，中国科学院生态环境研究中心, 北京 100085；,王风贺，南京师范大学环境学院, 南京 210023；,蒋新，中国科学院南京土壤研究所, 土壤环境与污染修复重点实验室, 南京 210008;中国科学院大学, 北京 100049；,叶茂，中国科学院南京土壤研究所, 土壤环境与污染修复重点实验室, 南京 210008;中国科学院大学, 北京 100049；yemao@issas.ac.cn,

关键词：土壤病毒;噬菌体;宏病毒组;功能基因;注释

基金：国家重点研发计划项目（2018YFC1803100）、中国科协青年人才托举工程（2018QNRC001）、国家自然科学基金面上项目（41771350）资助

土壤是病毒遗传多样性的储存库，但由于土壤自身特性及技术手段的限制，基于传统培养方法对土壤病毒的研究及功能认知存在局限性。宏病毒组学技术能直接从土壤环境样品中获取病毒基因组，随后通过高通量测序、拼接组装、ORF预测，最终可对病毒基因进行功能注释，极大地丰富了对土壤病毒功能的认识。本文在阐释土壤病毒DNA提取、测序与病毒判别、功能基因注释等研究方法的基础上，重点探讨了单株噬菌体基因组，及近年来国内外土壤与极端陆地环境中宏病毒组研究进展。并对土壤宏病毒基因组研究的前沿和发展趋势进行了总结，强调了土壤病毒研究的整体化、技术流程规范化以及病毒资源库完善化的重要性。

来源：2021年第3期

《土壤学报》期刊编辑部

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